第六个徽章是灵魂徽章，需要前往飞鸟市挑战超能力系道馆才能获得。从常青市出发向南穿越501号道路，途中会遇到野生宝可梦和其他训练家的挑战，抵达天狼市后向西进入连接道路，再向北走就能到达飞鸟市。道馆馆主娜姿擅长使用超能力系宝可梦，战胜她后就能拿到灵魂徽章。
进入飞鸟市需要先完成彩虹市的火箭队剧情。在彩虹市的百货大楼一楼找到老奶奶对话拿到茶，把茶交给城市右侧关卡处的警卫才能通行。飞鸟市的道馆内部设计成迷宫样式，需要踩对特定位置的传送点才能找到馆主。建议提前准备恶系或虫系宝可梦来克制超能力属性，鬼斯通和凯西都是不错的选择。
拿到灵魂徽章后，你的宝可梦等级限制会提升到70级，还能在野外使用冲浪技能。这个徽章对后期捕捉水系宝可梦很有帮助。记得在挑战道馆前把队伍里的宝可梦都恢复好状态，馆主娜姿的胡地速度很快，最好带上能抗超能力攻击的钢系或恶系宝可梦。
如果找不到路，可以先去彩虹市游戏厅解决火箭队事件，拿到透视镜后再来飞鸟市。游戏后期还能在飞鸟市旁边的格斗道馆获得沙瓦郎或艾比郎，虽然这里没有徽章但能扩充队伍实力。拿到第六个徽章就意味着离通关又近了一步，接下来就该准备挑战黄金市的格斗道馆了。
整个流程中最重要的就是记得在彩虹市拿茶，这是进入飞鸟市的关键。有些玩家可能会卡在道馆的传送迷宫，其实只要记住每次传送后的位置就能找到规律。第六徽章的获取难度适中，只要做好属性克制准备就能顺利通过。
